엔비디아 AtacWorks, AI 기반 DNA 연구

엔비디아의 게놈 연구

엔비디아

엔비디아와 하버드의 과학자들은 유전자 연구에서 큰 발전을 이루었습니다. 이 연구팀은 단세포 실험을 실행하는 데 필요한 시간과 비용을 크게 줄일 수 있는 딥러닝 툴킷을 개발했습니다. Nature에 발표된 한 연구에 따르면, AtacWorks 툴킷은 전체 게놈에 대해 추론을 실행할 수 있습니다. 보통 이틀이 조금 넘는 시간을 단 30분만에 실행할 수 있다고 합니다. 이는 엔비디아의 Tensor Core GPU 덕분에 그렇게 할 수 있다고 합니다.

 

AtacWorks는 ATAC-seq와 협력합니다. 이는 질병에 걸린 세포의 게놈에서 개방된 영역을 찾기 위해 설계된 방법을 말합니다. 이러한 "개방 영역"은 특정한 기능을 결정하고 활성화시키는 데 사용되는 사람의 DNA의 하위 섹션입니다. 이것은 사람이 알츠하이머, 심장병, 암을 가질 수 있는지에 대한 과학자들의 지표를 줄 수 있는 사람의 게놈의 일부입니다.

 

ATAC-sec은 보통 수만 개의 셀을 분석해야 하지만, AtacWorks는 훨씬더 적은 수의 셀만 사용하여 동일한 결과를 얻을 수 있습니다. 연구원들은 또한 전통적인 방법으로는 연구 할 수 없는 하위 유형인 적혈구 및 백혈구를 생성하는 줄기 세포 데이터 세트에 AtacWorks를 적용했습니다. 그리고 AtacWorks를 통해, 그들은 각각 백혈구와 적혈구와 관련된 DNA의 분리된 부분을 확인할 수 있었습니다.

 

게놈

AtacWorks의 장점, 중요성

게놈을 더 빠르고 더 싸게 분석하는 능력은 특정 질병을 일으킬 수 있는 특정한 돌연변이나 생체 표지를 식별하는 데 큰 도움이 될 것입니다. 그것은 심지어 연구원들이 이 질병이 어떻게 작용하는지를 알아내는데 도움을 줌으로써 약물을 발견하는 데 도움을 줄 수도 있습니다.

 

이 논문의 저자이자 엔비디아의 연구원은 매우 희귀한 세포 유형의 경우, 기존 방법을 사용하여 DNA 차이를 연구하는 것은 불가능하다고 합니다. AtacWorks는 크로마틴 접근성 데이터 수집 비용을 낮출 뿐만 아니라 약물 발견 및 진단 분야에서 새로운 가능성을 열 수 있도록 지원합니다.